“She’s not” или “she isn’t”? Что лучше?

Абсолютно правильны и равноправны обе формы, но чисто статистически форма she’s not более употребительна, например:

She’s not here – Её здесь нет (статистически более употребительный ва­ри­ант)

She isn’t here – Её здесь нет (статистически менее употребительный ва­ри­ант)

Но если подлежащим является не местоимение, а существительное, то абсолютно нормально употреблять форму isn’t, например:

Mary isn’t here – Мэри здесь нет

Более подробное объяснение см. здесь.

См. также “He’s not” или “he isn’t”?, “It’s not” или “it isn’t”?, “We’re not” или “we aren’t”?, “You’re not” или “you aren’t”?, “They’re not” или “they aren’t”?