“You’re not” или “you aren’t”? Что лучше?

Абсолютно правильны и равноправны обе формы, но чисто статистически форма you’re not более употребительна, например:

You’re not tired – Ты не устал(а) • Вы не устали (статистически более употребительный ва­ри­ант)

You aren’t tired – Ты не устал(а) • Вы не устали (статистически менее употребительный ва­ри­ант)

Но если подлежащим или одним из подлежащих является не местоимение, а существительное, то абсолютно нормально употреблять форму aren’t, например:

Your friends and you aren’t tired – Вы с друзьями не устали

Более подробное объяснение см. здесь.

См. также “He’s not” или “he isn’t”?, “She’s not” или “she isn’t”?, “It’s not” или “it isn’t”?, “We’re not” или “we aren’t”?, “They’re not” или “they aren’t”?